Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Znf608Q56A10 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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Znf608Q56A10 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms