Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms