Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp235Q499D5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms