Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx25Q3ZT31 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Snx25Q3ZT31 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx25Q3ZT31 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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