Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Fam220aQ3ZN08 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Fam220aQ3ZN08 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Fam220aQ3ZN08 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam220aQ3ZN08 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam220aQ3ZN08 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam220aQ3ZN08 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam220aQ3ZN08 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam220aQ3ZN08 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam220aQ3ZN08 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam220aQ3ZN08 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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