Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc110Q3V125 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms