Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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