Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW5

Rnf10, RING finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf10Q3UIW5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf10Q3UIW5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms