Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms