Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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