Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms