Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdgfl1Q2VPR5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdgfl1Q2VPR5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms