Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1aQ2LKU9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms