Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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