Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ptchd1Q14B62 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ptchd1Q14B62 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ptchd1Q14B62 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ptchd1Q14B62 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ptchd1Q14B62 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ptchd1Q14B62 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ptchd1Q14B62 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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