Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam83bQ0VBM2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam83bQ0VBM2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms