Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TrioQ0KL02 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms