Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700061G19RikQ08EE8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms