Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm3Q08189 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tgm3Q08189 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms