Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
F13bQ07968 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F13bQ07968 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
F13bQ07968 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms