Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Siah1bQ06985 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Siah1bQ06985 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms