Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnb1Q03717 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnb1Q03717 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms