Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms