Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Runx1Q03347 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Runx1Q03347 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms