Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RykQ01887 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RykQ01887 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RykQ01887 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RykQ01887 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RykQ01887 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RykQ01887 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RykQ01887 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RykQ01887 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RykQ01887 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RykQ01887 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RykQ01887 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RykQ01887 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RykQ01887 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RykQ01887 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RykQ01887 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RykQ01887 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RykQ01887 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RykQ01887 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms