Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms