Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp1Q01514 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms