Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms