Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SeleQ00690 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms