Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
F8a1Q00558 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
F8a1Q00558 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms