Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms