Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43bP86448 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms