Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms