Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux2P70298 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux2P70298 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux2P70298 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux2P70298 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux2P70298 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cux2P70298 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux2P70298 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux2P70298 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux2P70298 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cux2P70298 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms