Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf5P70191 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf5P70191 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf5P70191 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms