Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcbP68404 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms