Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bace1P56818 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bace1P56818 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms