Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GemP55041 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GemP55041 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GemP55041 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GemP55041 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GemP55041 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GemP55041 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GemP55041 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms