Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux1P53564 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux1P53564 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms