Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Map3k1P53349 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms