Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec1P51908 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms