Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt2P50752 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnnt2P50752 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms