Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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