Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hoxc13P50207 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hoxc13P50207 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hoxc13P50207 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hoxc13P50207 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hoxc13P50207 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hoxc13P50207 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hoxc13P50207 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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