Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Abcd1P48410 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Abcd1P48410 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Abcd1P48410 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Abcd1P48410 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Abcd1P48410 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Abcd1P48410 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Abcd1P48410 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Abcd1P48410 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Abcd1P48410 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcd1P48410 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Abcd1P48410 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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