Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd4P46935 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms