Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf1P46099 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms