Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtgfrP43117 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtgfrP43117 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtgfrP43117 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtgfrP43117 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtgfrP43117 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtgfrP43117 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtgfrP43117 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtgfrP43117 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtgfrP43117 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtgfrP43117 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtgfrP43117 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtgfrP43117 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtgfrP43117 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtgfrP43117 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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