Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtbP41155 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtbP41155 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtbP41155 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LtbP41155 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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