Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms